MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio cholerae M66-2 chromosome II

Total Repeats: 16760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012580	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
2	NC_012580	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811636
3	NC_012580	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	227811636
4	NC_012580	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
5	NC_012580	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
6	NC_012580	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
7	NC_012580	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	227811636
8	NC_012580	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	227811636
9	NC_012580	AAAAGC	2	12	1546	1557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	227811636
10	NC_012580	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	227811636
11	NC_012580	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	227811636
12	NC_012580	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
13	NC_012580	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811636
14	NC_012580	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
15	NC_012580	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	227811636
16	NC_012580	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
17	NC_012580	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
18	NC_012580	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	227811636
19	NC_012580	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811636
20	NC_012580	TC	3	6	1928	1933	0 %	50 %	0 %	50 %	227811636
21	NC_012580	A	6	6	1944	1949	100 %	0 %	0 %	0 %	227811636
22	NC_012580	GC	3	6	2091	2096	0 %	0 %	50 %	50 %	227811636
23	NC_012580	T	6	6	2190	2195	0 %	100 %	0 %	0 %	227811636
24	NC_012580	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811636
25	NC_012580	ACA	2	6	2249	2254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
26	NC_012580	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
27	NC_012580	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
28	NC_012580	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
29	NC_012580	TC	3	6	2405	2410	0 %	50 %	0 %	50 %	227811636
30	NC_012580	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	227811636
31	NC_012580	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811636
32	NC_012580	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	227811636
33	NC_012580	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811636
34	NC_012580	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
35	NC_012580	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811636
36	NC_012580	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811636
37	NC_012580	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811636
38	NC_012580	GT	3	6	2873	2878	0 %	50 %	50 %	0 %	227811636
39	NC_012580	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811636
40	NC_012580	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811636
41	NC_012580	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	227811636
42	NC_012580	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	227811636
43	NC_012580	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
44	NC_012580	TGAGAT	2	12	3415	3426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
45	NC_012580	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	227811637
46	NC_012580	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811637
47	NC_012580	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
48	NC_012580	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	227811637
49	NC_012580	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811637
50	NC_012580	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811637
51	NC_012580	GT	3	6	3763	3768	0 %	50 %	50 %	0 %	227811637
52	NC_012580	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	227811637
53	NC_012580	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811637
54	NC_012580	A	7	7	3811	3817	100 %	0 %	0 %	0 %	227811637
55	NC_012580	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811638
56	NC_012580	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
57	NC_012580	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811638
58	NC_012580	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	227811638
59	NC_012580	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811638
60	NC_012580	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	475645757
61	NC_012580	A	7	7	4548	4554	100 %	0 %	0 %	0 %	475645757
62	NC_012580	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	475645757
63	NC_012580	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	475645757
64	NC_012580	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
65	NC_012580	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811640
66	NC_012580	A	6	6	4973	4978	100 %	0 %	0 %	0 %	227811640
67	NC_012580	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	227811640
68	NC_012580	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811640
69	NC_012580	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	227811640
70	NC_012580	CA	3	6	5193	5198	50 %	0 %	0 %	50 %	227811640
71	NC_012580	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
72	NC_012580	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811640
73	NC_012580	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811640
74	NC_012580	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	227811640
75	NC_012580	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811640
76	NC_012580	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811640
77	NC_012580	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811640
78	NC_012580	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811640
79	NC_012580	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
80	NC_012580	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
81	NC_012580	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	475645758
82	NC_012580	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	475645758
83	NC_012580	TGG	2	6	6010	6015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
84	NC_012580	TG	3	6	6051	6056	0 %	50 %	50 %	0 %	475645758
85	NC_012580	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	475645758
86	NC_012580	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	475645758
87	NC_012580	GC	3	6	6148	6153	0 %	0 %	50 %	50 %	475645758
88	NC_012580	GTCT	2	8	6195	6202	0 %	50 %	25 %	25 %	475645758
89	NC_012580	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	475645758
90	NC_012580	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	475645758
91	NC_012580	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	475645758
92	NC_012580	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	475645758
93	NC_012580	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	475645758
94	NC_012580	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	475645758
95	NC_012580	GC	3	6	6636	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
96	NC_012580	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
97	NC_012580	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	227811642
98	NC_012580	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
99	NC_012580	T	6	6	6845	6850	0 %	100 %	0 %	0 %	227811642
100	NC_012580	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811642
101	NC_012580	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	227811642
102	NC_012580	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
103	NC_012580	TG	3	6	6963	6968	0 %	50 %	50 %	0 %	227811642
104	NC_012580	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
105	NC_012580	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	227811642
106	NC_012580	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
107	NC_012580	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
108	NC_012580	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	227811642
109	NC_012580	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	227811642
110	NC_012580	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
111	NC_012580	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811642
112	NC_012580	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	227811642
113	NC_012580	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
114	NC_012580	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	227811642
115	NC_012580	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
116	NC_012580	CT	3	6	7477	7482	0 %	50 %	0 %	50 %	227811642
117	NC_012580	GC	3	6	7542	7547	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
118	NC_012580	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811642
119	NC_012580	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	227811642
120	NC_012580	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811642
121	NC_012580	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	227811642
122	NC_012580	TA	3	6	7685	7690	50 %	50 %	0 %	0 %	227811642
123	NC_012580	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811642
124	NC_012580	GC	4	8	7714	7721	0 %	0 %	50 %	50 %	227811642
125	NC_012580	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
126	NC_012580	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	227811642
127	NC_012580	ATAG	2	8	8003	8010	50 %	25 %	25 %	0 %	227811642
128	NC_012580	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811642
129	NC_012580	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
130	NC_012580	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811642
131	NC_012580	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	227811642
132	NC_012580	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	475645759
133	NC_012580	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
134	NC_012580	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	475645759
135	NC_012580	TC	3	6	8773	8778	0 %	50 %	0 %	50 %	475645759
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262	NC_012580	TGC	2	6	15769	15774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811646
263	NC_012580	GCG	2	6	15780	15785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811646
264	NC_012580	ATC	2	6	15901	15906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	227811646
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266	NC_012580	TTG	2	6	16071	16076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	227811646
267	NC_012580	CCG	2	6	16098	16103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	227811646
268	NC_012580	TGC	2	6	16195	16200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811646
269	NC_012580	TGC	2	6	16252	16257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	227811646
270	NC_012580	TGG	2	6	16263	16268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	227811646
271	NC_012580	CGA	2	6	16288	16293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811646
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275	NC_012580	TTC	3	9	16452	16460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	227811646
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277	NC_012580	GGC	2	6	16520	16525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811646
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282	NC_012580	GGC	2	6	16772	16777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811646
283	NC_012580	GAA	2	6	16917	16922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	227811646
284	NC_012580	GCA	2	6	16957	16962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	227811646
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286	NC_012580	GGC	2	6	17383	17388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	227811647
287	NC_012580	GAT	2	6	17470	17475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811647
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293	NC_012580	GAT	2	6	18136	18141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	227811647
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295	NC_012580	CCA	2	6	18165	18170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811647
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301	NC_012580	GGTTT	2	10	18617	18626	0 %	60 %	40 %	0 %	227811647
302	NC_012580	ACC	2	6	18695	18700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	227811647
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372	NC_012580	GT	3	6	22470	22475	0 %	50 %	50 %	0 %	227811649
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